Hóa đơn đầu vào có rủi ro khi công ty giải thể thường bị cơ quan thuế rà soát kỹ nhằm xác định giao dịch có phát sinh thực tế và đáp ứng điều kiện khấu trừ, tính chi phí hay không. Doanh nghiệp cần kiểm tra tình trạng nhà cung cấp, thời điểm phát hành hóa đơn, nội dung hàng hóa, dịch vụ, phương thức thanh toán và sự phù hợp với hoạt động kinh doanh. Hồ sơ giải trình nên có hợp đồng, báo giá, phiếu giao hàng, biên bản nghiệm thu, chứng từ vận chuyển, sao kê và tài liệu chứng minh hàng hóa đã nhập kho hoặc dịch vụ đã được sử dụng.
Hóa đơn đầu vào có rủi ro khi công ty giải thể phải được xử lý theo từng giao dịch cụ thể, không nên giải trình chung chung hoặc chỉ cung cấp bản hóa đơn. Doanh nghiệp cần chứng minh đầy đủ quá trình mua bán, giao nhận, thanh toán và sử dụng hàng hóa, dịch vụ. Nếu hóa đơn không đáp ứng điều kiện, công ty nên chủ động điều chỉnh thuế và chi phí trước khi cơ quan thuế
kết luận. Việc rà soát sớm giúp hạn chế truy thu, tiền phạt và tránh làm kéo dài thủ tục chấm dứt mã số thuế.
